فيما يلي عناوين بعض الكتب التي أصدرها الدكتور محمد أركون:
الفكر العربي. الإسلام بين الأمس والغد. تاريخية الفكر العربي الإسلامي. الفكر الإسلامي: قراءة علمية. الإسلام: الأخلاق والسياسة. الإسلام: نقد واجتهاد. من الاجتهاد إلى نقد العقل الإسلامي. من فيصل التفرقة إلى فصل المقال. أين هو الفكر الإسلامي المعاصر؟ الإسلام، أوروبا، الغرب. رهانات المعنى وإرادات الهيمنة. نزعة الأنسنة في الفكر العربي. جيل مسكويه والتوحيدي. العلمنة والدين: الإسلام، المسيحية، الغرب. نافذة على الإسلام. قضايا في نقد العقل الديني، كيف نفهم الإسلام اليوم؟ الفكر الأصولي واستحالة التأصيل، نحو تاريخ آخر للفكر الإسلامي. معارك من أجل الأنسنة في السياقات الإسلامية.